การศึกษาระบุคุณลักษณะของ SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86: รูปแบบใหม่ภายใต้นาฬิกา goatbet ประเมินเชิงทดลองของแอนติเจนและการติดเชื้อของ BA.2.86 ซึ่งเป็นตัวแปรเกลือสำหรับกลุ่มอาการทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรงชนิดติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2 (SARS-CoV-2) ที่เพิ่งเกิดขึ้นใหม่ ซึ่งถูกกำหนดให้เป็นตัวแปรภายใต้การติดตาม (VUM) โดยองค์การอนามัยโลก (WHO) เมื่อวันที่ 18 สิงหาคม 2566

จนถึงขณะนี้ นักวิจัยตรวจพบลำดับจีโนมของ BA.2.86 เพียง 24 ลำดับเท่านั้น อย่างไรก็ตาม มีต้นกำเนิดมาจากบุคคลในหลายประเทศที่ไม่มีประวัติการเดินทาง แม้ว่าลำดับ BA.2.86 อาจไม่เกี่ยวข้องกับระบาดวิทยาใดๆ แต่ตัวแปรนี้แสดงให้เห็นถึงศักยภาพในการแพร่กระจายทั่วโลก นอกจากนี้ BA.2.86 ยังมีการกลายพันธุ์มากกว่า BA.2 และ XBB.1.5 รุ่นก่อนๆ มากมาย ซึ่งบ่งบอกถึงแอนติเจนที่แตกต่างกันอย่างชัดเจนของมัน

การกลายพันธุ์ที่เป็นสื่อกลางในการต้านทานที่เพิ่มขึ้นต่อพลาสมาพักฟื้นจากการติดเชื้อที่ก้าวหน้าของ XBB (BTI) และการติดเชื้อซ้ำนั้นซ้อนอยู่ภายในโดเมนที่มีผลผูกพันกับตัวรับ (RBD) ของไกลโคโปรตีนที่ขัดขวาง (S) ของมัน นอกจากนี้ การกลายพันธุ์ในโดเมนปลาย N (NTD) และโดเมนย่อย 1 (SD1) ของ BA.2.86 มีส่วนทำให้ความต้านทานเพิ่มขึ้น 

ดูเหมือนว่า BA.2.86 ได้แลกกับการติดเชื้อของตนเพื่อรับความสามารถในการหลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันที่สูงขึ้นในระหว่างการวิวัฒนาการ ซึ่งเรียกร้องให้มีการติดตามอย่างใกล้ชิด

เกี่ยวกับการศึกษา

ในการศึกษาครั้งนี้ นักวิจัยได้พัฒนาไวรัสหลอก BA.2.86 ก่อน จากนั้นจึงตรวจวัดระยะห่างของแอนติเจนจากชนิดไวด์ไทป์ (WT) และสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ก่อนหน้าอื่นๆ รวมถึงสายพันธุ์ย่อยของ Omicron, BA.5, BQ.1.1 และ XBB

นอกจากนี้ยังประเมินความสามารถในการหลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันของไวรัสหลอก BA.2.86 ด้วยเหตุนี้ พวกเขาจึงทำการทดสอบการทำให้เป็นกลางด้วยไวรัสเทียมโดยใช้ตัวอย่างพลาสมาจากสองกลุ่มและเทียบกับแผงโมโนโคลนอลแอนติบอดี (mAbs) 

กลุ่มแรกประกอบด้วยบุคคล 27 รายที่ได้รับ XBB BTI เพียงครั้งเดียวหลังการฉีดวัคซีน และกลุ่มที่สองมีการพักฟื้น 54 รายที่ติดเชื้อ XBB (ซ้ำ) หลังจาก BTI จาก BA.5/BF.7 ผู้เข้าร่วมทุกคนได้รับวัคซีนเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (โควิด-19) ชนิดเชื้อตาย 3 โดสก่อน XBB BTI

นอกจากนี้ ทีมงานยังวิเคราะห์การกลายพันธุ์ที่สำคัญของ RBD ของ BA.2.86 จากที่พบใน XBB.1.5 ซึ่งพวกเขาได้ทดสอบแผงของแอนติบอดีที่เป็นกลาง (nAbs) กับไวรัสหลอกที่ใช้ XBB.1.5 ซึ่งมีการกลายพันธุ์ของ RBD BA.2.86 หนึ่งตัว ในที่สุด ทีมงานได้ประเมินการติดเชื้อในเซลล์ของ BA.2.86 โดยการทดสอบประสิทธิภาพของรูปแบบไวรัสปลอมในการติดเชื้อในเซลล์ hACE2-HEK293T

ผลลัพธ์

BA.2.86 แสดงการเคลื่อนตัวของแอนติเจนที่เด่นชัดจากสายพันธุ์ WT, BA.2/BA.5 และ XBB.1.5 SARS-CoV-2 ซึ่งบ่งชี้ว่ามันสามารถหลบเลี่ยงแอนติบอดีที่เหนี่ยวนำโดย XBB ได้อย่างมาก นอกจากนี้ยังแสดงความต้านทานสูงเป็นพิเศษในการทดสอบการทำให้เป็นกลางในทุกกลุ่มที่ได้รับการฉีดวัคซีน

สิ่งที่น่าสนใจคือศักยภาพในการหลบเลี่ยงทางภูมิคุ้มกันของ BA.2.86 เกิน EG.5 แต่เทียบเคียงได้กับตัวแปร "FLip" ของ Omicron HK.3 ซึ่งเป็นสายพันธุ์กลายคู่ที่มีการกลายพันธุ์แบบผสม L455F และ F456L แม้จะมีระดับการหลีกเลี่ยงภูมิคุ้มกันที่เทียบเคียงได้ แต่กิจกรรมสัมพัทธ์ของ HK.3 และ BA.2.86 นั้นแตกต่างกันไปในแต่ละตัวอย่าง ซึ่งบ่งชี้ถึงระยะห่างของแอนติเจน นอกจากนี้ BA.2.86 ชักนำให้เกิดการหลีกเลี่ยงแอนติบอดีที่สูงขึ้นอย่างเห็นได้ชัดกับพลาสมาที่ถูกกระตุ้นด้วย XBB ยกเว้น SA55 mAbs อื่นๆ ที่ทดสอบในการศึกษานี้ล้มเหลวในการทำให้ BA.2.86 เป็นกลาง

ที่สำคัญ การกลายพันธุ์ E554K เมื่อรวมกับการกลายพันธุ์ของ XBB.1.5 ช่วยเพิ่มการหลีกเลี่ยงพลาสมาของ BA.2.86 ซึ่งบ่งชี้ว่า nAbs ที่กำหนดเป้าหมาย SD1 ส่วนใหญ่ประกอบด้วยพลาสมาพักฟื้นที่กระตุ้นด้วย XBB นอกจากนี้ การกลายพันธุ์ NTD ของ BA.2.86 ยังปรับปรุงการหลีกเลี่ยงการทำให้เป็นกลางอีกด้วย

ในการสอบวิเคราะห์หลอกไวรัส เทียบกับ XBB.1.5 และ EG.5.1/EG.5, BA.2.86 มีการติดเชื้อต่ำที่สุด ผู้เขียนตั้งข้อสังเกตว่าการกลายพันธุ์ของ K356T, V483del และ E554K ส่วนใหญ่มีส่วนทำให้การติดเชื้อลดลง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง K356T ได้แนะนำแม่ลายไกลโคซิเลชันแบบเชื่อมโยง N สำหรับไซต์กรดอะมิโน N354 และ V483del อยู่ใกล้กับไซต์ที่จับกับเอนไซม์ที่แปลง angiotensin 2 (ACE2) โดยทั้งสองเหตุการณ์ส่งผลต่อประสิทธิภาพการเข้าสู่เซลล์โฮสต์ของไวรัส

นักวิจัยวัดการติดเชื้อ BA.2.86 โดยการตรวจวิเคราะห์ด้วยไวรัสหลอก ดังนั้นผลลัพธ์เหล่านี้จึงจำเป็นต้องมีการตรวจสอบเพิ่มเติมโดยใช้ไอโซเลทแท้ 

บทสรุป

ข้อมูลการศึกษาชี้ให้เห็นว่า BA.2.86 มีศักยภาพในการหลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันที่ยอดเยี่ยม เมื่อเทียบกับสายพันธุ์ Omicron ของ SARS-CoV-2 ที่หมุนเวียนอยู่ในปัจจุบัน นอกจากนี้ BA.2.86 ยังมีแอนติเจนอยู่ไกลจากแวเรียนต์ของ Omicron ทั้งหมดที่ทดสอบและสามารถหนี nAbs ที่เกิดจาก XBB ได้ กล่าวคือ ต้านทานภูมิคุ้มกันทางร่างกายที่กระตุ้นโดย XBB และ mAbs ที่มีประสิทธิภาพ XBB

แม้ว่าปัจจุบันดูเหมือนว่า บ.2.86 อาจจะไม่ชนะเนื่องจากมีการติดเชื้อน้อยกว่าก็ตาม อย่างไรก็ตาม ถ้ามันกลายพันธุ์เพิ่มเติมในระหว่างการวิวัฒนาการและการแพร่กระจายของไวรัสโฮสต์ มันอาจเพิ่มการติดเชื้อได้ เมื่อพิจารณาถึงศักยภาพที่จะกลายเป็นตัวแปร SARS-CoV-2 ที่มีอิทธิพลเหนือกว่าในเร็วๆ นี้ เช่นเดียวกับตัวแปรย่อย XBB ของ Omicron ความร่วมมือระดับโลกจึงเป็นสิ่งจำเป็นในการสร้างแผนภูมิวิวัฒนาการ BA.2.86 เมื่อเวลาผ่านไป